El Supremo Tribunal de Justicia del Estado
El titular del Poder Judicial es el Supremo Tribunal de Justicia del Estado de Sonora, el cual está integrado por siete magistrados, de los cuales uno es su presidente.
Para ser magistrado del Supremo Tribunal de Justicia se requiere ser mexicano por nacimiento, en pleno ejercicio de sus derechos políticos y civiles, tener cuando menos dieciocho años cumplidos y título de Licenciado en Derecho por lo menos diez años antes de la designación.
También es necesario gozar de buena reputación, haber residido en el país durante los dos años anteriores a su nombramiento y no haber ocupado en el Estado el cargo de Secretario o su equivalente en la Administración Pública Estatal, de Procurador General de Justicia o de Diputado Local durante un año previo a su designación. El Gobernador del Estado propone a la aprobación del congreso del Estado el nombramiento del los magistrados del Supremo Tribunal de Justicia. El nombramiento de estos magistrados es por nueve años.
El Pleno
Cuando los siete magistrados se reúnen en la sala de sesiones a debatir los asuntos que se deben resolver se dice que el Supremo Tribunal de Justicia funciona en Pleno. No es necesario que todos los magistrados estén presentes para llegar a una determinación. En su caso, basta la participación de cinco magistrados para que las decisiones del Pleno tengan validez.
Las Salas
Como juzgado de Segunda Instancia ( donde revisa y resuelve sentencias sobre delitos mayores, como homicidio, por ejemplo), el Supremo Tribunal funciona en dos Salas Mixtas, las que atienden diversas materias. Cada una de ellas está integrada por tres magistrados, pero basta con la presencia de dos para que éstas funcionen. El presidente del Supremo Tribunal no participa en ninguna de ellas.